الکتروفورز عمودی برای جداسازی DNA، RNA و پروتئین در تکنیک­‌های مختلفی مانند الکتروفورز با رزولوشن بالای اسیدهای نوکلئیک، آنزیموگرافی، وسترن­‌بلات، ساترن­‌بلات و نورترن­‌بلات مورد استفاده قرار می­‌گیرد.